Identificación de genes involucrados en la diferenciación de Sclerotium cepivorum

Ingrid Aimée Chagolla Badillo

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DC Field	Value	Language
dc.rights.license	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0	es_MX
dc.creator	Ingrid Aimée Chagolla Badillo	-
dc.date.accessioned	2021-05-31T16:35:25Z	-
dc.date.available	2021-05-31T16:35:25Z	-
dc.date.issued	2018-11-26	-
dc.identifier.uri	http://repositorio.ugto.mx/handle/20.500.12059/5062	-
dc.description.abstract	La enfermedad denominada “pudrición blanca del ajo” causada por el hongo Sclerotium cepivorum Berk es difícil de controlar, debido a que el hongo forma esclerocios, que son estructuras de propagación muy resistentes. El conocimiento del proceso de diferenciación nos permitirá diseñar estrategias para el control de la enfermedad. El uso de herramientas bioinformáticas permite predecir la presencia de genes implicados en la conidiación y/o formación del esclerocio en S. cepivorum. Se han encontrado los ortólogos de los genes: Bcltf1, Bcltf2, Bchox8, Bcvel1, Bcvel2, Bclae1, Bcwcl1, Bcwcl2, Bcatf1, Bcreg1, Bcpks13, Ssltf2, VosA, VeA, FphA, LreA.; reportados en B. cinerea, S.sclerotiorum, A.Flavus y A.nidulans. Utilizando el algoritmo BLAST se recuperaron las secuencias en el genoma de S. cepivorumy posteriormente se predijeran los elementos regulatorios y motivos o dominios de cada uno de los ortólogos identificados. Por último, se diseñaron oligonucleótidos para amplificar los genes encontrados. Concluyendo así, que la bioinformática genera un escenario más certero y eficiente; ahorrando tiempo/recursos para la experimentación.	es_MX
dc.language.iso	spa	es_MX
dc.publisher	Universidad de Guanajuato	es_MX
dc.relation	http://www.jovenesenlaciencia.ugto.mx/index.php/jovenesenlaciencia/article/view/2585	-
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess	es_MX
dc.source	Jóvenes en la Ciencia: Verano de la Investigación Científica. Vol. 4, Num 1 (2018)	es_MX
dc.title	Identificación de genes involucrados en la diferenciación de Sclerotium cepivorum	es_MX
dc.type	info:eu-repo/semantics/article	es_MX
dc.subject.cti	info:eu-repo/classification/cti/6	es_MX
dc.subject.keywords	Bioinformática	es_MX
dc.subject.keywords	Genes	es_MX
dc.subject.keywords	Ortólogos	es_MX
dc.subject.keywords	Conidiación	es_MX
dc.subject.keywords	Esclerocio	es_MX
dc.type.version	info:eu-repo/semantics/publishedVersion	es_MX
dc.creator.two	David García Estrada	-
dc.creator.three	ALBERTO FLORES MARTINEZ	-
dc.creator.idthree	info:eu-repo/dai/mx/cvu/210368	es_MX
dc.description.abstractEnglish	The disease called "white garlic rot" caused by the fungus Sclerotium cepivorum Berk is difficult to control, because the fungus forms sclerotia, which are very resistant propagation structures. The knowledge of the process of differentiation will allow us to design strategies for the control of the disease. The use of bioinformatic tools allows to predict the presence of genes involved in the conidiation and / or formation of the sclerotium in S. cepivorum. The orthologs of the genes: Bcltf1, Bcltf2, Bchox8, Bcvel1, Bcvel2, Bclae1, Bcwcl1, Bcwcl2, Bcatf1, Bcreg1, Bcpks13, Ssltf2, VosA, VeA, FphA, LreA, LreB; reported in B. cinerea and S. sclerotiorum, A.flavus and A.nidulans have been found. Using the BLAST algorithm, the sequences in the genome of S. cepivorum were recovered and subsequently the regulatory elements and motifs or domains of each one of the identified orthologs were predicted. Finally, oligonucleotides were designed to amplify the genes found. Concluding thus, that bioinformatics generates a more accurate and efficient scenario; saving time / resources for experimentation.	-
Appears in Collections:	Revista Jóvenes en la Ciencia

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